Científicos do CISC lograron secuenciar o SARS-COV-2, o virus que provoca a Covid-19 nas augas residuais das localidades galegas, un logro que permite identificar que variante circula por cada zona.
Os traballos desenvolvidos polo equipo liderado por Antonio Figueras e Beatriz Novoa concluíron coa secuenciación do virus da covid-19 en tres localidades das 15 que forman parte do estudo do proxecto ' DIMcoVAR'.
Así, tras un ano de investigación empregando técnicas de secuenciación masiva, os científicos chegaron a identificar que tipo de SARS-COV-2 circula no concello de Baiona e nas localidades de Noia e Melide.
"En Noia e Melide as mutacións detectadas son compatíbeis coa variante española e europea, mentres que en Baiona destacan as compatíbeis coa británica, surafricana e brasileira", sinalou Beatriz Novoa, segundo recolle un comunicado de prensa.
En relación á circulación do virus en Baiona, os investigadores apuntan á identificación da proteína ' Spike' como clave para identificar as mutacións procedentes doutras zonas.
O fito alcanzado por este grupo do CISC permite coñecer "o pool" do virus circulante en cada zona e conseguir a identificación das mutacións máis frecuentes e aquelas variantes que implican maior risco para os humanos.
Todo iso a través da análise das feces."Desde que se detectou o material xenético do virus en mostras de feces de pacientes infectados, houbo un interese a nivel internacional pola monitoraxe do SARS- CoV-2 en augas residuais", destacan os líderes da investigación, Antonio Figueras e Beatriz Novoa, directores do grupo de Inmunoloxía e Xenómica do IIM.
A investigación iniciouse pouco despois da chegada do virus ao Estado e Galiza e desenvólvese en 15 depuradoras de Baiona, Nigrán, Gondomar, Cambados, Moraña, Porto de Son, Muros, Melide, Ares, Cedeira, Noia, Pobra do Caramiñal, Betanzos, Viveiro e Burela.
Nun primeiro momento, as análises centráronse na secuenciación das mostras de auga que deran positivo mediante proba PCR. Con todo, pasados uns meses, os investigadores decatáronse da dificultade de secuenciación das mostras, xa que o virus "áchase moi fragmentado nas mostras de augas residuais".
Desde setembro de 2020, os traballos pasaron estar enfocados á aplicación de varias metodoloxías para secuenciar as mostras a través de técnicas de identificación masiva que requiren pouca cantidade de material xenético pero que achegan "millóns de secuencias" de SARS- COV-2.
"O conseguir detectar as mutacións que están a circular nunha localidade é moi valioso para identificar variantes. Hai que ter en conta que nas augas residuais concéntrase todo, incluso os virus de persoas asintomáticas que non acoden ao hospital. De aí a súa importancia", destacou Antonio Figueras.
Entre os resultados da secuencación do virus nas augas residuais de Noia, Melide e Baiona, destaca a "prevalencia abafadora" da cepa británica nesta última localidade, onde foron identificadas "mutacións únicas" que definen esta variante e, ademais, outras que que a fan compatíbel coa surafricana, a brasileira e outras.
